Забекапим все бд:

mysqldump --lock-all-tables -u root -p --all-databases > dump.sql

Удалим старый mysql

sudo apt-get remove mysql-server
sudo apt-get autoremove

Установим новый:

sudo apt-get install mysql-client-5.6 mysql-client-core-5.6
sudo apt-get install mysql-server-5.6

Восстановим базы данных:

mysql -u root -p < dump.sql

Предыдущие

• Less watcher для phpstorm
• Установка youtrack на CentOS / Install youtrack on CentOS
• Установка Hg (mercurial) на vps Linux CentOS с доступом по http(s)
• Установка mongodb на ubuntu 14.04
• Как установить php-redis на ubuntu 14.04